2044年的纽约，大反派朗格勾结外星恶势力试图毁灭地球，大量外星人通过神秘传送门入侵，将城市化为灰烬。忍者神龟们虽负隅顽抗仍不敌敌人攻势，死伤惨重。怀抱着忍者最强武器——希望，忍者神龟们决定回到过去时空，找到开启传送门的钥匙，阻止朗格，恢复世界和平。莱昂纳多的弟子凯西肩负起这一使命，他在过去时空与女记者艾普奥尼尔成功接头，并和忍者神龟莱昂纳多、米开朗基罗、拉斐尔、多纳泰罗汇合，开启了拯救世界的行动。“我们的未来，我们自己做主”，忍者神龟们向朗格发起了终极挑战。
演员：布耐恩·布莱塞得 格伦·克洛斯 明妮·德里弗 托尼·戈德温 奈杰尔·霍桑 兰斯·亨利克森 韦恩·奈特 亚历克斯·D·林兹 罗茜·欧唐内 杰克·安杰尔 约瑟夫·阿什顿 鲍伯·伯根 罗德格尔·邦帕斯 莉莉·柯林斯 凯特·克雷西达 吉姆·卡明斯 Aria Noelle Curzon 詹妮弗·达林 黛比·德里贝里 Patti Deutsch 保罗·伊丁 布莱克·麦克莱弗·尤因 斯科特·马丁·格尔琴 Sam Gifaldi 杰姬·戈诺 麦卡·霍普特曼 Grady Hutt 雪莉·琳恩 丹尼·曼恩 杰森·马斯登 米凯
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